La Ayudantía Mayor de la Unidad de Base tiene por misión dirigir los servicios de infraestructura, proporcionar los servicios de acuartelamientoa las unidades y ejercer la jefatura del personal con destino en la Unidad de Base.
En el aspecto de infraestructura ha sido y es pieza importantedentro de la profunda remodelación que se está realizando en el TEAR, manteniendo una constante supervisión sobre las obras que se llevan realizando desde 1996.

En los servicios de acuartelamiento realiza pequeñas reparaciones de infraestructura, carpintería, pintura, sastrería, etc. También presta el servicio de contraincendios.
Por último, en el aspecto de personal, ejerce el mando de la Unidad de Dotación donde se lleva el control administrativo del personal de la Unidad de Base y donde se atiende a su instrucción básica como todo infante de marina